《我的宠物恐龙》讲述的是小男主人公杰克和他的朋友查尔斯、阿贝等人痴迷于UFO，经常到森林“狩猎UFO”，遗憾的是他们并没有找到任何外星生物的痕迹，却意外收集了一些奇怪的粘质物，并将其带回了家。机缘巧合之下，杰克用粘质物创造出了一只恐龙，一只十分可爱的、充满好奇心、形似剑龙的变色恐龙，并取名 “马格纳

在一个风景如画的英国乡村，自然学家查尔斯·达尔文（保罗·贝坦尼 Paul Bettany 饰）与妻女一起过着恬静的生活。他十岁的大女儿安妮对世界充满好奇，达尔文便教予她很多自然和科学知识，其中还包括他的进化论，然而在世人都相信上帝乃造物主的当时，女儿口中的进化论无疑是危险的，以至于令她被家庭教师体罚